Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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