Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms