Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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