Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms