Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms