Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms