Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms