Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rfx8D3YU81 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rfx8D3YU81 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rfx8D3YU81 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rfx8D3YU81 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rfx8D3YU81 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rfx8D3YU81 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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