Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Phf11bB4XVQ1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Phf11bB4XVQ1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Phf11bB4XVQ1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Phf11bB4XVQ1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Phf11bB4XVQ1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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