Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Phf11cB4XVP9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Phf11cB4XVP9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Phf11cB4XVP9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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