Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms