Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms