Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssxb8B1AY40 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms