Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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