Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms