Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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