Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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