Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms