Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms