Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc163A2AGD7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms