Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RNP2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms