Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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