Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms