Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms