Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms