Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms