Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms