Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Col4a4Q9QZR9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Col4a4Q9QZR9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Col4a4Q9QZR9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Col4a4Q9QZR9 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms