Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms