Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms