Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Tnnt3Q9QZ47 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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