Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms