Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Limd1Q9QXD8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Limd1Q9QXD8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms