Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms