Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sfmbt1Q9JMD1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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