Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cabp1Q9JLK7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Cabp1Q9JLK7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Cabp1Q9JLK7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Cabp1Q9JLK7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cabp1Q9JLK7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms