Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms