Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms