Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms