Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup50Q9JIH2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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