Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rtn3Q9ES97 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rtn3Q9ES97 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rtn3Q9ES97 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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