Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms