Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms