Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph3bQ9DA80 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph3bQ9DA80 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph3bQ9DA80 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms