Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9DA42 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9DA42 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms