Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Snx5Q9D8U8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Snx5Q9D8U8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Snx5Q9D8U8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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