Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn23Q9D7D7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn23Q9D7D7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn23Q9D7D7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn23Q9D7D7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn23Q9D7D7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn23Q9D7D7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn23Q9D7D7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn23Q9D7D7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn23Q9D7D7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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