Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms