Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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PrameQ9D4Z5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PrameQ9D4Z5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PrameQ9D4Z5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PrameQ9D4Z5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PrameQ9D4Z5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PrameQ9D4Z5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PrameQ9D4Z5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PrameQ9D4Z5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PrameQ9D4Z5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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PrameQ9D4Z5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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