Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf6Q9D4J7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms